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BARDINI, ROBERTA

BARDINI, ROBERTA  

Dipartimento di Automatica e Informatica  

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A diversity-aware computational framework for systems biology / Bardini, Roberta. - (2019 Sep 18), pp. 1-147. 18-set-2019 BARDINI, ROBERTA conv_bardini_phd_thesis_v1.pdf; conv_phd_thesis_abstract_bardini.pdf
A Methodology for Co-simulation-Based Optimization of Biofabrication Protocols / Giannantoni, L; Bardini, R; Di Carlo, S. - ELETTRONICO. - 13347:(2022), pp. 179-192. (Intervento presentato al convegno International Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering (IWBBIO) 2022 tenutosi a Gran Canaria nel Jun. 27-30, 2022) [10.1007/978-3-031-07802-6_16]. 1-gen-2022 Giannantoni LBardini RDi Carlo S 2022.01.28.478198.full.pdf; 978-3-031-07802-6_16.pdf; paper_91.pdf
Computational Tools for Applying Multi-level Models to Synthetic Biology / Bardini, R.; Politano, G.; Benso, A.; Di Carlo, S. - In: Synthetic Biology: Omics Tools and Their Applications / S. Singh. - STAMPA. - Singapore : Springer, 2018. - ISBN 978-981-10-8692-2. - pp. 95-112 [10.1007/978-981-10-8693-9_7] 1-gen-2018 R. BardiniG. PolitanoA. BensoS. Di Carlo -
GAGAM v1.2: An Improvement on Peak Labeling and Genomic Annotated Gene Activity Matrix Construction / Martini, Lorenzo; Bardini, Roberta; Savino, Alessandro; DI CARLO, Stefano. - In: GENES. - ISSN 2073-4425. - ELETTRONICO. - 14:1(2023). [10.3390/genes14010115] 1-gen-2023 Lorenzo MartiniRoberta BardiniAlessandro SavinoStefano Di Carlo genes-14-00115.pdf
GAGAM: A Genomic Annotation-Based Enrichment of scATAC-seq Data for Gene Activity Matrix / Martini, Lorenzo; Bardini, Roberta; Savino, Alessandro; DI CARLO, Stefano. - ELETTRONICO. - 13347:(2022), pp. 18-32. (Intervento presentato al convegno International Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering (IWBBIO) 2022 tenutosi a Gran Canaria nel Jun. 27-30, 2022) [10.1007/978-3-031-07802-6_2]. 1-gen-2022 Lorenzo MartiniRoberta BardiniAlessandro SavinoStefano Di Carlo Martini2022_Chapter_GAGAMAGenomicAnnotation-BasedE.pdf; IWBBIO_2022___Single_Cell (2).pdf
High-resolution sample size enrichment of single-cell multi-modal low-throughput Patch-seq datasets / Martini, Lorenzo; Bardini, Roberta; Savino, Alessandro; Di Carlo, Stefano. - ELETTRONICO. - (2022), pp. 2334-2341. (Intervento presentato al convegno 2022 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM) tenutosi a Las Vegas (USA) nel Dec. 6-8, 2022) [10.1109/BIBM55620.2022.9995529]. 1-gen-2022 Martini, LorenzoBardini, RobertaSavino, AlessandroDi Carlo, Stefano High-resolution_sample_size_enrichment_of_single-cell_multi-modal_low-throughput_Patch-seq_datasets.pdf; 2022___IEEE_BIBM___Number_cells_enrichment (1).pdf
Meta-Analysis of cortical inhibitory interneurons markers landscape and their performances in scRNA-seq studies / Martini, Lorenzo; Bardini, Roberta; DI CARLO, Stefano. - ELETTRONICO. - (2021), pp. 253-258. (Intervento presentato al convegno 2021 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM) tenutosi a Houston (USA) nel Dec. 9-12, 2021) [10.1109/bibm52615.2021.9669888]. 1-gen-2021 Lorenzo MartiniRoberta BardiniStefano Di Carlo 2021___IEE_BIBM.pdf; Meta-Analysis_of_cortical_inhibitory_interneurons_markers_landscape_and_their_performances_in_scRNA-seq_studies..pdf
Meta-analysis of Gene Activity (MAGA) Contributions and Correlation with Gene Expression, Through GAGAM / Martini, L.; Bardini, R.; Savino, A.; Di Carlo, S.. - ELETTRONICO. - 13920:(2023), pp. 193-207. (Intervento presentato al convegno 10th International Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering (IWBBIO 2023) tenutosi a Meloneras, Gran Canaria (ESP) nel 12-14 July 2023) [10.1007/978-3-031-34960-7_14]. 1-gen-2023 Martini L.Bardini R.Savino A.Di Carlo S. 978-3-031-34960-7_14.pdf; IWBBIO23-MAGA.pdf
Metodo computerizzato per generare protocolli di coltura per bio-manufacturing / Bardini, Roberta; Di Carlo, Stefano; Benso, Alfredo; Politano, Gianfranco. - (2020). 1-gen-2020 Bardini, RobertaDi Carlo, StefanoBenso, AlfredoPolitano, Gianfranco -
Metodo di simulazione via computer dell'ontogenesi di un sistema biologico e, opzionalmente, di generazione di un protocollo di coltura / Bardini, Roberta; Di Carlo, Stefano; Benso, Alfredo; Politano, Gianfranco. - (2019). 1-gen-2019 Bardini, RobertaDi Carlo, StefanoBenso, AlfredoPolitano, Gianfranco -
Modeling antibiotic resistance in the microbiota using Multi-level Petri Nets / Bardini, Roberta; DI CARLO, Stefano; Politano, GIANFRANCO MICHELE MARIA; Benso, Alfredo. - In: BMC SYSTEMS BIOLOGY. - ISSN 1752-0509. - ELETTRONICO. - 12:6(2018), pp. 1-21. [10.1186/s12918-018-0627-1] 1-gen-2018 Roberta BardiniStefano Di CarloGianfranco PolitanoAlfredo Benso s12918-018-0627-1.pdf
Modeling biological complexity using Biology System Description Language (BiSDL) / Muggianu, Flavia; Benso, A.; Bardini, R.; Hu, E.; Politano, G.; Carlo, S. Di. - STAMPA. - (2018), pp. 713-717. (Intervento presentato al convegno IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine, BIBM 2018 tenutosi a Madrid, Spain nel 3-6 Dec. 2018) [10.1109/BIBM.2018.8621533]. 1-gen-2018 MUGGIANU, FLAVIABenso, A.Bardini, R.Politano, G.Carlo, S. Di + PID5654585.pdf
Multi-level and hybrid modelling approaches for systems biology / Bardini, Roberta; Politano, GIANFRANCO MICHELE MARIA; Benso, Alfredo; DI CARLO, Stefano. - In: COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL BIOTECHNOLOGY JOURNAL. - ISSN 2001-0370. - STAMPA. - 15:(2017), pp. 396-402. [10.1016/j.csbj.2017.07.005] 1-gen-2017 BARDINI, ROBERTAPOLITANO, GIANFRANCO MICHELE MARIABENSO, ALFREDODI CARLO, STEFANO 1-s2.0-S2001037017300314-main.pdf
Nets-within-nets for modeling emergent patterns in ontogenetic processes / Bardini, Roberta; Benso, Alfredo; Politano, Gianfranco; Di Carlo, Stefano. - In: COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL BIOTECHNOLOGY JOURNAL. - ISSN 2001-0370. - ELETTRONICO. - 19:(2021), pp. 5701-5721. [10.1016/j.csbj.2021.10.008] 1-gen-2021 Bardini, RobertaBenso, AlfredoPolitano, GianfrancoDi Carlo, Stefano NWN_CElegans.pdf; 1-s2.0-S200103702100430X-main.pdf
Using multi-level Petri nets models to simulate microbiota resistance to antibiotics / Bardini, R.; Politano, G.; Benso, A.; Di Carlo, S.. - STAMPA. - (2017), pp. 128-133. (Intervento presentato al convegno 2017 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM 2017) tenutosi a Kansas City, MO, USA nel 13-16 Nov. 2017) [10.1109/BIBM.2017.8217637]. 1-gen-2017 Bardini, R.Politano, G.Benso, A.Di Carlo, S. camera_ready.pdf
Using Nets-Within-Nets for Modeling Differentiating Cells in the Epigenetic Landscape / Bardini, Roberta; Benso, Alfredo; DI CARLO, Stefano; Politano, GIANFRANCO MICHELE MARIA; Savino, Alessandro. - STAMPA. - 9656:(2016), pp. 315-321. (Intervento presentato al convegno 4th International Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering (IWBBIO) tenutosi a Granada, Spain nel April 20-22, 2016) [10.1007/978-3-319-31744-1_28]. 1-gen-2016 BARDINI, ROBERTABENSO, AlfredoDI CARLO, STEFANOPOLITANO, GIANFRANCO MICHELE MARIASAVINO, ALESSANDRO IWBBIO.2106.PetriNets.pdf