Archivio Istituzionale della RicercaPACIELLO, GIULIA
MDM2 and Aurora Kinase a Contribute to SETD2 Loss of Function in Advanced Systemic Mastocytosis: Implications for Pathogenesis and Treatment
2018 Mancini, Manuela; Monaldi, Cecilia; De Santis, Sara; Papayannidis, Cristina; Rondoni, Michela; Bavaro, Luana; Martelli, Margherita; Maria Chiara, Abbenante; Curti, Antonio; Ficarra, Elisa; Paciello, Giulia; Chiara Fontana, Maria; Zanotti, Roberta; Bonifacio, Massimiliano; Scaffidi, Luigi; Pagano, Livio; Criscuolo, Marianna; Albano, Francesco; Ciceri, Fabio; Elena, Chiara; Tosi, Patrizia; Delledonne, Massimo; Avanzato, Carla; Xumerle, Luciano; Valent, Peter; Martinelli, GIOVANNI ATTILIO; Cavo, Michele; Soverini, Simona
RALE051: a novel established cell line of sporadic Burkitt lymphoma
2018 L’Abbate, Alberto; Iacobucci, Ilaria; Lonoce, Angelo; Turchiano, Antonella; Ficarra, Elisa; Paciello, Giulia; Cattina, Federica; Ferrari, Anna; Imbrogno, Enrica; Agostinelli, Claudio; Zinzani, Pierluigi; Martinelli, Giovanni; Derenzini, Enrico; Storlazzi, Clelia Tiziana
FuGePrior: A novel gene fusion prioritization algorithm based on accurate fusion structure analysis in cancer RNA-seq samples
2017 Paciello, Giulia; Ficarra, Elisa
isomiR-SEA: An RNA-Seq analysis tool for miRNAs/isomiRs expression level profiling and miRNA-mRNA interaction sites evaluation
2016 Urgese, Gianvito; Paciello, Giulia; Acquaviva, Andrea; Ficarra, Elisa
Novel fusion transcripts identified by RNAseq cooperate with somatic mutations in the pathogenesis of acute myeloid leukemia
2016 Antonella, Padella; Giorgia, Simonetti; Anna, Ferrari; Paciello, Giulia; Elisa, Zago; Carmen, Baldazzi; Viviana, Guadagnuolo; Cristina, Papayannidis; Valentina, Robustelli; Enrica, Imbrogno; Nicoletta, Testoni; Massimo, Delledonne; Ilaria, Iacobucci; Tiziana Clelia, Storlazzi; Ficarra, Elisa; Pier Luigi, Lollini; Giovanni, Martinelli
The Genomic and Transcriptomic Landscape of Systemic Mastocytosis
2016 Simona, Soverini; Caterina De, Benedittis; Michela, Rondoni; Cristina, Papayannidis; Ficarra, Elisa; Paciello, Giulia; Marco, Manfrini; Manuela, Mancini; Roberta, Zanotti; Luigi, Scaffidi; Giorgina, Specchia; Francesco, Albano; Serena, Merante; Chiara, Elena; Livio, Pagano; Domenica, Gangemi; Patrizia, Tosi; Luana, Bavaro
RNA Sequencing Reveals Novel and Rare Fusion Transcripts in Acute Myeloid Leukemia
2015 Padella, A.; Simonetti, G.; Paciello, Giulia; Ferrari, A.; Zago, E.; Baldazzi, C.; Guadagnuolo, V.; Papayannidis, C.; Robustelli, V.; Imbrogno, E.; Testoni, N.; Musuraca, G.; Soverini, S.; Delledonne, M.; Iacobucci, I.; Storlazzi, C. T.; Ficarra, Elisa; Martinelli, G.
VDJSeq-Solver: In Silico V(D)J Recombination Detection tool
2015 Paciello, Giulia; Acquaviva, Andrea; Chiara, Pighi; Alberto, Ferrarini; Macii, Enrico; Alberto, Zamò; Ficarra, Elisa
Next-Generation Sequencing Analysis Revealed That BCL11B Chromosomal Translocation Cooperates with Point Mutations in the Pathogenesis of Acute Myeloid Leukemia
2014 Antonella, Padella; Giorgia, Simonetti; Viviana, Guadagnuolo; Emanuela, Ottaviani; Anna, Ferrari; Elisa, Zago; Francesca, Griggio; Marianna, Garonzi; Paciello, Giulia; Simona, Bernardi; Carmen, Baldazzi; Cristina, Papayannidis; Maria Chiara, Abbenante; Francesca, Volpato; Raffaele, Calogero; Nicoletta, Testoni; Ficarra, Elisa; Alberto, Ferrarini; Massimo, Delledonne; Ilaria, Iacobucci; Giovanni, Martinelli
Bellerophontes: a RNA-seq data analysis framework tor chimeric transcripts discovery base on accurate fusion model
2012 Abate, Francesco; Acquaviva, Andrea; Paciello, Giulia; Foti, Carmelo; Ficarra, Elisa; Ferrarini, A.; Delle donne, M.; Iacobucci, I.; Soverini, S.; Martinelli, G.; Macii, Enrico
Multiscale Modelling of Cellular Actin Filaments: From Atomistic Molecular to Coarse Grained Dynamics
2012 Deriu, MARCO AGOSTINO; Shkurti, Ardita; Paciello, Giulia; Bidone, TAMARA CARLA; Morbiducci, Umberto; Ficarra, Elisa; Audenino, Alberto; Acquaviva, Andrea
A Molecular Dynamics study of a miRNA:mRNA interaction
2011 Paciello, Giulia; Acquaviva, Andrea; Ficarra, Elisa; Deriu, MARCO AGOSTINO; Macii, Enrico
| Citazione | Data di pubblicazione | Autori | File |
|---|---|---|---|
| MDM2 and Aurora Kinase a Contribute to SETD2 Loss of Function in Advanced Systemic Mastocytosis: Implications for Pathogenesis and Treatment / Mancini, M., Monaldi, C., De Santis, S., Papayannidis, C., Rondoni, M., Bavaro, L., Martelli, M., Maria Chiara, A., Curti, A., Ficarra, E., Paciello, G., Chiara Fontana, M., Zanotti, R., Bonifacio, M., Scaffidi, L., Pagano, L., Criscuolo, M., Albano, F., Ciceri, F., Elena, C., et al.. - In: BLOOD. - ISSN 0006-4971. - ELETTRONICO. - 132:1(2018), pp. 1779-1779. [10.1182/blood-2018-99-113278] | 1-gen-2018 | Elisa FicarraGiulia PacielloGiovanni Martinelli + | - |
| RALE051: a novel established cell line of sporadic Burkitt lymphoma / L’Abbate, A., Iacobucci, I., Lonoce, A., Turchiano, A., Ficarra, E., Paciello, G., Cattina, F., Ferrari, A., Imbrogno, E., Agostinelli, C., Zinzani, P., Martinelli, G., Derenzini, E., Storlazzi, C.T.. - In: LEUKEMIA & LYMPHOMA. - ISSN 1042-8194. - ELETTRONICO. - 59:5(2018), pp. 1252-1255. [10.1080/10428194.2017.1372580] | 1-gen-2018 | Ficarra, ElisaPaciello, Giulia + | - |
| FuGePrior: A novel gene fusion prioritization algorithm based on accurate fusion structure analysis in cancer RNA-seq samples / Paciello, G., Ficarra, E.. - In: BMC BIOINFORMATICS. - ISSN 1471-2105. - 18:1(2017), pp. 1-12. [10.1186/s12859-016-1450-6] | 1-gen-2017 | PACIELLO, GIULIAFICARRA, ELISA | 12859_2016_Article_1450_FuGePrior.pdf |
| isomiR-SEA: An RNA-Seq analysis tool for miRNAs/isomiRs expression level profiling and miRNA-mRNA interaction sites evaluation / Urgese, G., Paciello, G., Acquaviva, A., Ficarra, E.. - In: BMC BIOINFORMATICS. - ISSN 1471-2105. - ELETTRONICO. - 17:148(2016). [10.1186/s12859-016-0958-0] | 1-gen-2016 | URGESE, GIANVITOPACIELLO, GIULIAACQUAVIVA, ANDREAFICARRA, ELISA | s12859-016-0958-0.pdf |
| Novel fusion transcripts identified by RNAseq cooperate with somatic mutations in the pathogenesis of acute myeloid leukemia / Antonella, P., Giorgia, S., Anna, F., Paciello, G., Elisa, Z., Carmen, B., Viviana, G., Cristina, P., Valentina, R., Enrica, I., Nicoletta, T., Massimo, D., Ilaria, I., Tiziana Clelia, S., Ficarra, E., Pier Luigi, L., Giovanni, M.. - In: CANCER RESEARCH. - ISSN 1538-7445. - 76:14(2016), pp. 113-113. [10.1158/1538-7445.AM2016-113] | 1-gen-2016 | PACIELLO, GIULIAFICARRA, ELISA + | - |
| The Genomic and Transcriptomic Landscape of Systemic Mastocytosis / Simona, S., Caterina De, B., Michela, R., Cristina, P., Ficarra, E., Paciello, G., Marco, M., Manuela, M., Roberta, Z., Luigi, S., Giorgina, S., Francesco, A., Serena, M., Chiara, E., Livio, P., Domenica, G., Patrizia, T., Luana, B.. - In: BLOOD. - ISSN 0006-4971. - 128:22(2016). [10.1182/blood.V128.22.3136.3136] | 1-gen-2016 | FICARRA, ELISAPACIELLO, GIULIA + | - |
| RNA Sequencing Reveals Novel and Rare Fusion Transcripts in Acute Myeloid Leukemia / Padella, A., Simonetti, G., Paciello, G., Ferrari, A., Zago, E., Baldazzi, C., Guadagnuolo, V., Papayannidis, C., Robustelli, V., Imbrogno, E., Testoni, N., Musuraca, G., Soverini, S., Delledonne, M., Iacobucci, I., Storlazzi, C.T., Ficarra, E., Martinelli, G.. - In: BLOOD. - ISSN 0006-4971. - 126:(2015), pp. 3627-3627. | 1-gen-2015 | PACIELLO, GIULIAFICARRA, ELISA + | - |
| VDJSeq-Solver: In Silico V(D)J Recombination Detection tool / Paciello, G., Acquaviva, A., Chiara, P., Alberto, F., Macii, E., Alberto, Z., Ficarra, E.. - In: PLOS ONE. - ISSN 1932-6203. - ELETTRONICO. - 10:3(2015), pp. 1-26. [10.1371/journal.pone.0118192] | 1-gen-2015 | PACIELLO, GIULIAACQUAVIVA, ANDREAMACII, EnricoFICARRA, ELISA + | VDJSeq-Solver.pdf |
| Next-Generation Sequencing Analysis Revealed That BCL11B Chromosomal Translocation Cooperates with Point Mutations in the Pathogenesis of Acute Myeloid Leukemia / Antonella, P., Giorgia, S., Viviana, G., Emanuela, O., Anna, F., Elisa, Z., Francesca, G., Marianna, G., Paciello, G., Simona, B., Carmen, B., Cristina, P., Maria Chiara, A., Francesca, V., Raffaele, C., Nicoletta, T., Ficarra, E., Alberto, F., Massimo, D., Ilaria, I., et al.. - In: BLOOD. - ISSN 0006-4971. - ELETTRONICO. - 124:21(2014). | 1-gen-2014 | PACIELLO, GIULIAFICARRA, ELISA + | - |
| Bellerophontes: a RNA-seq data analysis framework tor chimeric transcripts discovery base on accurate fusion model / Abate, F., Acquaviva, A., Paciello, G., Foti, C., Ficarra, E., Ferrarini, A., Delle donne, M., Iacobucci, I., Soverini, S., Martinelli, G., Macii, E.. - In: BIOINFORMATICS. - ISSN 1367-4803. - STAMPA. - 28:16(2012), pp. 2114-2121. [10.1093/bioinformatics/bts334] | 1-gen-2012 | ABATE, FRANCESCOACQUAVIVA, ANDREAPACIELLO, GIULIAFOTI, CARMELOFICARRA, ELISAMACII, Enrico + | - |
| Multiscale Modelling of Cellular Actin Filaments: From Atomistic Molecular to Coarse Grained Dynamics / Deriu, M.A., Shkurti, A., Paciello, G., Bidone, T.C., Morbiducci, U., Ficarra, E., Audenino, A., Acquaviva, A.. - In: PROTEINS. - ISSN 0887-3585. - ELETTRONICO. - 80:6(2012), pp. 1598-1609. [10.1002/prot.24053] | 1-gen-2012 | DERIU, MARCO AGOSTINOSHKURTI, ARDITAPACIELLO, GIULIABIDONE, TAMARA CARLAMORBIDUCCI, UMBERTOFICARRA, ELISAAUDENINO, AlbertoACQUAVIVA, ANDREA | - |
| A Molecular Dynamics study of a miRNA:mRNA interaction / Paciello, G., Acquaviva, A., Ficarra, E., Deriu, M.A., Macii, E.. - In: JOURNAL OF MOLECULAR MODELING. - ISSN 1610-2940. - STAMPA. - 17:11(2011), pp. 2895-2906. [10.1007/s00894-011-0991-x] | 1-gen-2011 | PACIELLO, GIULIAACQUAVIVA, ANDREAFICARRA, ELISADERIU, MARCO AGOSTINOMACII, Enrico | - |