SHKURTI, ARDITA

SHKURTI, ARDITA  

Dipartimento di Automatica e Informatica  

021764  

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Fast and Accurate Simulation Framework Targeting Molecular Dynamics for Cells Substructures / Shkurti, Ardita. - STAMPA. - (In corso di stampa). In corso di stampa SHKURTI, ARDITA -
Acceleration of Coarse Grain Molecular Dynamics on GPU Architectures / Shkurti, Ardita; Mario, Orsi; Macii, Enrico; Ficarra, Elisa; Acquaviva, Andrea. - In: JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY. - ISSN 0192-8651. - STAMPA. - 34:10(2013), pp. 803-818. [10.1002/jcc.23183] 1-gen-2013 SHKURTI, ARDITAMACII, EnricoFICARRA, ELISAACQUAVIVA, ANDREA + jccSHKURTI.pdf
Optimization of Molecular Dynamics Simulations from a High Performance Computing Viewpoint / Shkurti, Ardita; Mario, Orsi; Acquaviva, Andrea; Ficarra, Elisa; Macii, Enrico; Sophia, Wheeler; Jonathan W., Essex. - (2013). (Intervento presentato al convegno 2nd Annual CCP Bio-Sim Conference: Frontiers of Biomolecular Simulations tenutosi a Nottingham, United Kingdom nel 25-27 March 2013). 1-gen-2013 SHKURTI, ARDITAACQUAVIVA, ANDREAFICARRA, ELISAMACII, Enrico + -
CHARACTERIZATION OF COARSE GRAIN MOLECULAR DYNAMIC SIMULATION PERFORMANCE ON GRAPHIC PROCESSING UNIT ARCHITECTURES / Shkurti, Ardita; Acquaviva, Andrea; Ficarra, Elisa; Orsi, M.; Macii, Enrico. - STAMPA. - (2012), pp. 339-342. (Intervento presentato al convegno International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms (BIOINFORMATICS 2012) tenutosi a Vilamoura, Algarve (Portugal) nel 1-4 Feb 2012) [10.5220/0003790703390342]. 1-gen-2012 SHKURTI, ARDITAACQUAVIVA, ANDREAFICARRA, ELISAMACII, Enrico + -
Characterization of coarse grain molecular dynamic simulation performance ongraphic processing unit architectures / Shkurti, Ardita; Acquaviva, Andrea; Ficarra, Elisa; Orsi, Mario; Macii, Enrico. - (2012), pp. 339-342. (Intervento presentato al convegno International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms, BIOINFORMATICS 2012 tenutosi a Vilamoura, Algarve, prt nel 2012). 1-gen-2012 Shkurti, ArditaAcquaviva, AndreaFicarra, ElisaMacii, Enrico + -
Multiscale Modelling of Cellular Actin Filaments: From Atomistic Molecular to Coarse Grained Dynamics / Deriu, MARCO AGOSTINO; Shkurti, Ardita; Paciello, Giulia; Bidone, TAMARA CARLA; Morbiducci, Umberto; Ficarra, Elisa; Audenino, Alberto; Acquaviva, Andrea. - In: PROTEINS. - ISSN 0887-3585. - ELETTRONICO. - 80:6(2012), pp. 1598-1609. [10.1002/prot.24053] 1-gen-2012 DERIU, MARCO AGOSTINOSHKURTI, ARDITAPACIELLO, GIULIABIDONE, TAMARA CARLAMORBIDUCCI, UMBERTOFICARRA, ELISAAUDENINO, AlbertoACQUAVIVA, ANDREA -
Towards Low Cost Virtual Biological Laboratories: Molecular Modelling Simulation on Commodity Hardware / Shkurti, Ardita; Acquaviva, Andrea; Ficarra, Elisa; Orsi, M.; Macii, Enrico; Essex, J. W.. - (2012). (Intervento presentato al convegno Young Modellers Forum tenutosi a Londra nel Novembre 2012). 1-gen-2012 SHKURTI, ARDITAACQUAVIVA, ANDREAFICARRA, ELISAMACII, Enrico + -
GPU Acceleration of Simulation Tool for Lipid-Bilayers / Shkurti, Ardita; Acquaviva, Andrea; Ficarra, Elisa; Mario, Orsi; Martino, Ruggiero; Macii, Enrico. - STAMPA. - (2010), pp. 849-850. (Intervento presentato al convegno IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine tenutosi a Hong Kong nel 18-21 Dec 2010). 1-gen-2010 SHKURTI, ARDITAACQUAVIVA, ANDREAFICARRA, ELISAMACII, Enrico + -