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Binding free energy calculation via Molecular Dynamics simulations for a miRNA:mRNA interaction
2011 Paciello, Giulia; Acquaviva, Andrea; Ficarra, Elisa; Deriu, MARCO AGOSTINO; Macii, Enrico
Biomechanics of actin filaments: a computational multi-level study
2011 Deriu, MARCO AGOSTINO; Bidone, TAMARA CARLA; Mastrangelo, Francesco; DI BENEDETTO, Giacomo; Soncini, Monica; Montevecchi, Franco Maria; Morbiducci, Umberto
Identification of the albumin-carbon nanotube interaction surface by molecular simulations
2012 Deriu, MARCO AGOSTINO; Carbone, Laura; Quaranta, G.; Grasso, G.; Audenino, Alberto; Morbiducci, Umberto
Mechanical Properties of Single-Walled Carbon Nanotubes
2012 Carbone, Laura; Deriu, MARCO AGOSTINO; Prunotto, A.; Bignardi, Cristina; Morbiducci, Umberto
Innovative Microgravity Perfusion Bioreactor for Hydrogel-based Regenerative Medicine
2012 CERINO ABDIN, Giulia; Massai, DIANA NADA CATERINA; Lorusso, Davide; Gallo, Diego; Pennella, Francesco; Deriu, MARCO AGOSTINO; Costantin, Ciobanu; Montevecchi, Franco Maria; Morbiducci, Umberto
Multiscale biomechanics of actin filaments and crosslinked networks
2012 Bidone, TAMARA CARLA; Taeyoon, Kim; Deriu, MARCO AGOSTINO; Morbiducci, Umberto; Roger D., Kamm
Effect of idealized versus measured inlet velocity profiles on image-based CFD of aortic hemodynamics
2012 Gallo, Diego; Ponzini, R.; Isu, Giuseppe; Pennella, Francesco; Deriu, MARCO AGOSTINO; De Santis, G.; Bignardi, Cristina; Rizzo, G.; Morbiducci, Umberto
Scale/Physics/Time properties and functions in bioartificial systems
2012 Bidone, TAMARA CARLA; Deriu, MARCO AGOSTINO; FALVO D'URSO LABATE, GIUSEPPE VITTORIO UGO; Massai, DIANA NADA CATERINA; Morbiducci, Umberto; Montevecchi, Franco Maria
On the use of in vivo measured flow rates as boundary conditions for image-based hemodynamic models of the human aorta. Implications for indicators of abnormal flow
2012 Gallo, Diego; De Santis, G.; Negri, F.; Tresoldi, D.; Ponzini, R.; Massai, DIANA NADA CATERINA; Deriu, MARCO AGOSTINO; Segers, P.; Verhegghe, B.; Rizzo, G.; Morbiducci, Umberto
A Survey of Microchannel Geometries for Mixing of Species in Biomicrofluidics
2012 Pennella, Francesco; Mastrangelo, Francesco; Gallo, Diego; Massai, DIANA NADA CATERINA; Deriu, MARCO AGOSTINO; FALVO D'URSO LABATE, GIUSEPPE VITTORIO UGO; Bignardi, Cristina; Montevecchi, Franco Maria; Morbiducci, Umberto
Multiscale Modelling of Cellular Actin Filaments: From Atomistic Molecular to Coarse Grained Dynamics
2012 Deriu, MARCO AGOSTINO; Shkurti, Ardita; Paciello, Giulia; Bidone, TAMARA CARLA; Morbiducci, Umberto; Ficarra, Elisa; Audenino, Alberto; Acquaviva, Andrea
Numerical and experimental characterization of a novel modular passive micromixer
2012 Pennella, Francesco; Rossi, Massimiliano; Ripandelli, Simone; Rasponi, Marco; Mastrangelo, Francesco; Deriu, MARCO AGOSTINO; Ridolfi, Luca; Kähler, C. J.; Morbiducci, Umberto
A virtual test bench to study transport phenomena in 3D porous scaffolds using lattice Boltzmann simulations
2013 Pennella, Francesco; Gentile, Piergiorgio; Deriu, MARCO AGOSTINO; Gallo, Diego; Schiavi, Alessandro; Ciardelli, Gianluca; Lorenz, E.; Hoekstra, A. G.; Audenino, Alberto; Morbiducci, Umberto
A Hydrophobic Gold Surface Triggers Misfolding and Aggregation of the Amyloidogenic Josephin Domain in Monomeric Form, While Leaving the Oligomers Unaffected
2013 Apicella, A.; Soncini, M.; Deriu, M. A.; Natalello, A.; Bonanomi, M.; Dellasega, D.; Tortora, P.; Regonesi, M. E.; Casari, C. S.
Bioreactors as engineering support to treat cardiac muscle and vascular disease
2013 Massai, DIANA NADA CATERINA; CERINO ABDIN, Giulia; Gallo, Diego; Pennella, Francesco; Deriu, MARCO AGOSTINO; RODRIGUEZ RUIZ, ANDRES FELIPE; Montevecchi, Franco Maria; Bignardi, Cristina; Audenino, Alberto; Morbiducci, Umberto
A survey of methods for the evaluation of tissue engineering scaffold permeability
2013 Pennella, Francesco; CERINO ABDIN, Giulia; Massai, DIANA NADA CATERINA; Gallo, Diego; Falvo D’Urso Labate, G.; Schiavi, A.; Deriu, MARCO AGOSTINO; Audenino, Alberto; Morbiducci, Umberto
Electro-acoustic behavior of the mitotic spindle: A semi-classical coarse-grained model
2014 Havelka, D.; Kucera, O.; Deriu, M. A.; Cifra, M.
A survey of quantitative descriptors of arterial flows
2014 Gallo, Diego; Isu, Giuseppe; Massai, DIANA NADA CATERINA; Pennella, Francesco; Deriu, MARCO AGOSTINO; Ponzini, R.; Bignardi, Cristina; Audenino, Alberto; Rizzo, G.; Morbiducci, Umberto
Investigation of the Josephin Domain Protein-Protein Interaction by Molecular Dynamics
2014 Deriu, MARCO AGOSTINO; Grasso, G.; Licandro, G.; Danani, A.; Gallo, Diego; Tuszynski, J. A.; Morbiducci, Umberto
A rational approach to defining principal axes of multidirectional wall shear stress in realistic vascular geometries, with application to the study of the influence of helical flow on wall shear stress directionality in aorta
2015 Morbiducci, Umberto; Gallo, Diego; Cristofanelli, S.; Ponzini, R.; Deriu, MARCO AGOSTINO; Rizzo, G.; Steinman, D. A.
| Citazione | Data di pubblicazione | Autori | File |
|---|---|---|---|
| Binding free energy calculation via Molecular Dynamics simulations for a miRNA:mRNA interaction / Paciello, Giulia; Acquaviva, Andrea; Ficarra, Elisa; Deriu, MARCO AGOSTINO; Macii, Enrico. - STAMPA. - (2011), pp. 318-321. (Intervento presentato al convegno Bioinformatics 2011, International Conference on Bioinformatics Models Methods and Algorithms tenutosi a Rome (IT) nel 26 - 29 January 2011). | 1-gen-2011 | PACIELLO, GIULIAACQUAVIVA, ANDREAFICARRA, ELISADERIU, MARCO AGOSTINOMACII, Enrico | - |
| Biomechanics of actin filaments: a computational multi-level study / Deriu, MARCO AGOSTINO; Bidone, TAMARA CARLA; Mastrangelo, Francesco; DI BENEDETTO, Giacomo; Soncini, Monica; Montevecchi, Franco Maria; Morbiducci, Umberto. - In: JOURNAL OF BIOMECHANICS. - ISSN 0021-9290. - ELETTRONICO. - 44:4(2011), pp. 630-636. [10.1016/j.jbiomech.2010.11.014] | 1-gen-2011 | DERIU, MARCO AGOSTINOBIDONE, TAMARA CARLAMASTRANGELO, FRANCESCODI BENEDETTO, GIACOMOSONCINI, MONICAMONTEVECCHI, Franco MariaMORBIDUCCI, UMBERTO | 2375658.pdf |
| Identification of the albumin-carbon nanotube interaction surface by molecular simulations / Deriu, MARCO AGOSTINO; Carbone, Laura; Quaranta, G.; Grasso, G.; Audenino, Alberto; Morbiducci, Umberto. - ELETTRONICO. - (2012). (Intervento presentato al convegno Terzo Congresso del Gruppo Nazionale di Bioingegneria). | 1-gen-2012 | DERIU, MARCO AGOSTINOCARBONE, LAURAAUDENINO, AlbertoMORBIDUCCI, UMBERTO + | - |
| Mechanical Properties of Single-Walled Carbon Nanotubes / Carbone, Laura; Deriu, MARCO AGOSTINO; Prunotto, A.; Bignardi, Cristina; Morbiducci, Umberto. - ELETTRONICO. - (2012), p. 327. (Intervento presentato al convegno Congresso Nazionale di Bioingegneria 2012 tenutosi a Roma nel June 26-29th, 2012). | 1-gen-2012 | CARBONE, LAURADERIU, MARCO AGOSTINOBIGNARDI, CRISTINAMORBIDUCCI, UMBERTO + | - |
| Innovative Microgravity Perfusion Bioreactor for Hydrogel-based Regenerative Medicine / CERINO ABDIN, Giulia; Massai, DIANA NADA CATERINA; Lorusso, Davide; Gallo, Diego; Pennella, Francesco; Deriu, MARCO AGOSTINO; Costantin, Ciobanu; Montevecchi, Franco Maria; Morbiducci, Umberto. - 45(S1):(2012), pp. S659-S659. (Intervento presentato al convegno 18th Congress of the European Society of Biomechanics tenutosi a Lisbon, (P) nel 1-4 July). | 1-gen-2012 | CERINO ABDIN, GIULIAMASSAI, DIANA NADA CATERINALORUSSO, DAVIDEGALLO, DIEGOPENNELLA, FRANCESCODERIU, MARCO AGOSTINOMONTEVECCHI, Franco MariaMORBIDUCCI, UMBERTO + | - |
| Multiscale biomechanics of actin filaments and crosslinked networks / Bidone, TAMARA CARLA; Taeyoon, Kim; Deriu, MARCO AGOSTINO; Morbiducci, Umberto; Roger D., Kamm. - (2012). (Intervento presentato al convegno BioMed 2012 tenutosi a Innsbruck (Austria) nel 15-17 February 2012) [10.2316/P.2012.764-175]. | 1-gen-2012 | BIDONE, TAMARA CARLADERIU, MARCO AGOSTINOMORBIDUCCI, UMBERTO + | - |
| Effect of idealized versus measured inlet velocity profiles on image-based CFD of aortic hemodynamics / Gallo, Diego; Ponzini, R.; Isu, Giuseppe; Pennella, Francesco; Deriu, MARCO AGOSTINO; De Santis, G.; Bignardi, Cristina; Rizzo, G.; Morbiducci, Umberto - In: Proceedings of the 6th European Congress on Computational Methods in Applied Sciences and Engineering (ECCOMAS 2012) / Eberhardsteiner J., Böhm H.J., Rammerstorfer F.G.. - Vienna : Vienna University of Technology, 2012. | 1-gen-2012 | GALLO, DIEGOISU, GIUSEPPEPENNELLA, FRANCESCODERIU, MARCO AGOSTINOBIGNARDI, CRISTINAMORBIDUCCI, UMBERTO + | - |
| Scale/Physics/Time properties and functions in bioartificial systems / Bidone, TAMARA CARLA; Deriu, MARCO AGOSTINO; FALVO D'URSO LABATE, GIUSEPPE VITTORIO UGO; Massai, DIANA NADA CATERINA; Morbiducci, Umberto; Montevecchi, Franco Maria. - 706-709:(2012), pp. 121-126. (Intervento presentato al convegno 7th International Conference on Processing and Manufacturing of Advanced Materials, THERMEC'2011 tenutosi a Quebec City (Canada) nel August 1-5, 2011). | 1-gen-2012 | BIDONE, TAMARA CARLADERIU, MARCO AGOSTINOFALVO D'URSO LABATE, GIUSEPPE VITTORIO UGOMASSAI, DIANA NADA CATERINAMORBIDUCCI, UMBERTOMONTEVECCHI, Franco Maria | - |
| On the use of in vivo measured flow rates as boundary conditions for image-based hemodynamic models of the human aorta. Implications for indicators of abnormal flow / Gallo, Diego; De Santis, G.; Negri, F.; Tresoldi, D.; Ponzini, R.; Massai, DIANA NADA CATERINA; Deriu, MARCO AGOSTINO; Segers, P.; Verhegghe, B.; Rizzo, G.; Morbiducci, Umberto. - In: ANNALS OF BIOMEDICAL ENGINEERING. - ISSN 0090-6964. - 40:3(2012), pp. 729-741. | 1-gen-2012 | GALLO, DIEGOMASSAI, DIANA NADA CATERINADERIU, MARCO AGOSTINOMORBIDUCCI, UMBERTO + | - |
| A Survey of Microchannel Geometries for Mixing of Species in Biomicrofluidics / Pennella, Francesco; Mastrangelo, Francesco; Gallo, Diego; Massai, DIANA NADA CATERINA; Deriu, MARCO AGOSTINO; FALVO D'URSO LABATE, GIUSEPPE VITTORIO UGO; Bignardi, Cristina; Montevecchi, Franco Maria; Morbiducci, Umberto - In: Single and Two-Phase Flows on Chemical and Biomedical Engineering / Dias R., Lima R., Martins A. A., Mata T. M.. - [s.l] : Bentham Science Publishers, 2012. - ISBN 9781608055043. - pp. 548-578 [10.2174/978160805295011201010548] | 1-gen-2012 | PENNELLA, FRANCESCOMASTRANGELO, FRANCESCOGALLO, DIEGOMASSAI, DIANA NADA CATERINADERIU, MARCO AGOSTINOFALVO D'URSO LABATE, GIUSEPPE VITTORIO UGOBIGNARDI, CRISTINAMONTEVECCHI, Franco MariaMORBIDUCCI, UMBERTO | - |
| Multiscale Modelling of Cellular Actin Filaments: From Atomistic Molecular to Coarse Grained Dynamics / Deriu, MARCO AGOSTINO; Shkurti, Ardita; Paciello, Giulia; Bidone, TAMARA CARLA; Morbiducci, Umberto; Ficarra, Elisa; Audenino, Alberto; Acquaviva, Andrea. - In: PROTEINS. - ISSN 0887-3585. - ELETTRONICO. - 80:6(2012), pp. 1598-1609. [10.1002/prot.24053] | 1-gen-2012 | DERIU, MARCO AGOSTINOSHKURTI, ARDITAPACIELLO, GIULIABIDONE, TAMARA CARLAMORBIDUCCI, UMBERTOFICARRA, ELISAAUDENINO, AlbertoACQUAVIVA, ANDREA | - |
| Numerical and experimental characterization of a novel modular passive micromixer / Pennella, Francesco; Rossi, Massimiliano; Ripandelli, Simone; Rasponi, Marco; Mastrangelo, Francesco; Deriu, MARCO AGOSTINO; Ridolfi, Luca; Kähler, C. J.; Morbiducci, Umberto. - In: BIOMEDICAL MICRODEVICES. - ISSN 1387-2176. - STAMPA. - 14:(2012), pp. 849-862. [10.1007/s10544-012-9665-4] | 1-gen-2012 | PENNELLA, FRANCESCOROSSI, MASSIMILIANORIPANDELLI, SIMONERASPONI, MARCOMASTRANGELO, FRANCESCODERIU, MARCO AGOSTINORIDOLFI, LUCAMORBIDUCCI, UMBERTO + | 2497862-1.pdf |
| A virtual test bench to study transport phenomena in 3D porous scaffolds using lattice Boltzmann simulations / Pennella, Francesco; Gentile, Piergiorgio; Deriu, MARCO AGOSTINO; Gallo, Diego; Schiavi, Alessandro; Ciardelli, Gianluca; Lorenz, E.; Hoekstra, A. G.; Audenino, Alberto; Morbiducci, Umberto. - (2013). (Intervento presentato al convegno ASME 2013 Summer Bioengineering Conference (SBC2013) tenutosi a Sunriver, Oregon, USA nel June 26-29). | 1-gen-2013 | PENNELLA, FRANCESCOGENTILE, PIERGIORGIODERIU, MARCO AGOSTINOGALLO, DIEGOSCHIAVI, ALESSANDROCIARDELLI, GIANLUCAAUDENINO, AlbertoMORBIDUCCI, UMBERTO + | - |
| A Hydrophobic Gold Surface Triggers Misfolding and Aggregation of the Amyloidogenic Josephin Domain in Monomeric Form, While Leaving the Oligomers Unaffected / Apicella, A.; Soncini, M.; Deriu, M. A.; Natalello, A.; Bonanomi, M.; Dellasega, D.; Tortora, P.; Regonesi, M. E.; Casari, C. S.. - In: PLOS ONE. - ISSN 1932-6203. - 8:3(2013), p. e58794. [10.1371/journal.pone.0058794] | 1-gen-2013 | Soncini M.Deriu M. A.Tortora P. + | - |
| Bioreactors as engineering support to treat cardiac muscle and vascular disease / Massai, DIANA NADA CATERINA; CERINO ABDIN, Giulia; Gallo, Diego; Pennella, Francesco; Deriu, MARCO AGOSTINO; RODRIGUEZ RUIZ, ANDRES FELIPE; Montevecchi, Franco Maria; Bignardi, Cristina; Audenino, Alberto; Morbiducci, Umberto. - In: JOURNAL OF HEALTHCARE ENGINEERING. - ISSN 2040-2295. - STAMPA. - 4:3(2013), pp. 329-370. [10.1260/2040-2295.4.3.329] | 1-gen-2013 | MASSAI, DIANA NADA CATERINACERINO ABDIN, GIULIAGALLO, DIEGOPENNELLA, FRANCESCODERIU, MARCO AGOSTINORODRIGUEZ RUIZ, ANDRES FELIPEMONTEVECCHI, Franco MariaBIGNARDI, CRISTINAAUDENINO, AlbertoMORBIDUCCI, UMBERTO | REVIEW BIOREATTORI Journal of Healthcare Engineering 2013.pdf |
| A survey of methods for the evaluation of tissue engineering scaffold permeability / Pennella, Francesco; CERINO ABDIN, Giulia; Massai, DIANA NADA CATERINA; Gallo, Diego; Falvo D’Urso Labate, G.; Schiavi, A.; Deriu, MARCO AGOSTINO; Audenino, Alberto; Morbiducci, Umberto. - In: ANNALS OF BIOMEDICAL ENGINEERING. - ISSN 0090-6964. - STAMPA. - 41:10(2013), pp. 2027-2041. [10.1007/s10439-013-0815-5] | 1-gen-2013 | PENNELLA, FRANCESCOCERINO ABDIN, GIULIAMASSAI, DIANA NADA CATERINAGALLO, DIEGODERIU, MARCO AGOSTINOAUDENINO, AlbertoMORBIDUCCI, UMBERTO + | - |
| Electro-acoustic behavior of the mitotic spindle: A semi-classical coarse-grained model / Havelka, D.; Kucera, O.; Deriu, M. A.; Cifra, M.. - In: PLOS ONE. - ISSN 1932-6203. - 9:1(2014), p. e86501. [10.1371/journal.pone.0086501] | 1-gen-2014 | Deriu M. A. + | - |
| A survey of quantitative descriptors of arterial flows / Gallo, Diego; Isu, Giuseppe; Massai, DIANA NADA CATERINA; Pennella, Francesco; Deriu, MARCO AGOSTINO; Ponzini, R.; Bignardi, Cristina; Audenino, Alberto; Rizzo, G.; Morbiducci, Umberto - In: Visualizations and simulations of complex flows in biomedical engineering[s.l] : Springer, 2014. - ISBN 9789400777699. - pp. 1-24 | 1-gen-2014 | GALLO, DIEGOISU, GIUSEPPEMASSAI, DIANA NADA CATERINAPENNELLA, FRANCESCODERIU, MARCO AGOSTINOBIGNARDI, CRISTINAAUDENINO, AlbertoMORBIDUCCI, UMBERTO + | - |
| Investigation of the Josephin Domain Protein-Protein Interaction by Molecular Dynamics / Deriu, MARCO AGOSTINO; Grasso, G.; Licandro, G.; Danani, A.; Gallo, Diego; Tuszynski, J. A.; Morbiducci, Umberto. - In: PLOS ONE. - ISSN 1932-6203. - ELETTRONICO. - 9:e108677(2014). [10.1371/journal.pone.0108677] | 1-gen-2014 | DERIU, MARCO AGOSTINOGALLO, DIEGOTuszynski J. A.MORBIDUCCI, UMBERTO + | - |
| A rational approach to defining principal axes of multidirectional wall shear stress in realistic vascular geometries, with application to the study of the influence of helical flow on wall shear stress directionality in aorta / Morbiducci, Umberto; Gallo, Diego; Cristofanelli, S.; Ponzini, R.; Deriu, MARCO AGOSTINO; Rizzo, G.; Steinman, D. A.. - In: JOURNAL OF BIOMECHANICS. - ISSN 0021-9290. - STAMPA. - 48:6(2015), pp. 899-906. [10.1016/j.jbiomech.2015.02.027] | 1-gen-2015 | MORBIDUCCI, UMBERTOGALLO, DIEGODERIU, MARCO AGOSTINO + | ARATIO~1.PDF |
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